16SrDNA鑒定是指用利用細菌16SrDNA序列測序的方法對細菌進行種屬鑒定。包括細菌基因組DNA提取、16SrDNA特異引物PCR擴增、擴增產(chǎn)物純化、DNA測序、序列比對等步驟。是一種快速獲得細菌種屬信息的方法。英文名稱是16S ribosomal DNA identification，應用有細菌種屬鑒定。
細菌rRNA（核糖體RNA）按沉降系數(shù)分為3種，分別為5S、16S和23S rRNA。16S rDNA是細菌染色體上編碼16S rRNA相對應的DNA序列，存在于所有細菌染色體基因中。
16S rDNA是細菌的系統(tǒng)分類研究中最有用的和最常用的分子鐘，其種類少，含量大（約占細菌RNA含量的80%），分子大小適中，存在于所有的生物中，其進化具有良好的時鐘性質(zhì)，在結(jié)構(gòu)與功能上具有高度的保守性，素有“細菌化石”之稱。在大多數(shù)原核生物中rDNA都具有多個拷貝，5S、16S、23S rDNA的拷貝數(shù)相同。16S rDNA由于大小適中，約1.5Kb左右，既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異，又能利用測序技術(shù)較容易地得到其序列，故被細菌學家和分類學家接受。
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16s RNA測序 |
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